RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	TVP15	Q03860	143 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YKL063C	YKL063C	TAZ1	Q06510	381 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YKL063C	YKL063C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YKL063C	YKL063C	YDL144C	Q07589	356 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YKL063C	YKL063C	SUR2	P38992	349 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	PES4	P39684	611 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	RAD7	P06779	565 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YCR102C	P25608	368 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YHR035W	P38769	630 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YGR016W	P53209	190 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	COS6	P53344	381 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	SPO77	Q06134	477 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YLL007C	Q07799	665 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	COT1	P32798	439 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	SEN34	P39707	275 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	RPE1	P46969	238 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	UBC13	P52490	153 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	OKP1	P53298	406 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	STE23	Q06010	1027 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YDR089W	P38966	869 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	GON7	P46984	123 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	MND1	P53102	219 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	INA22	P40576	216 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	GDS1	P41913	522 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	PSY3	Q12318	242 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	UBR2	Q07963	1872 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	GAL3	P13045	520 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	ATG15	P25641	520 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YOR062C	P36025	268 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	POP8	P38208	133 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	YHR045W	P38775	560 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	EMC6	Q12431	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YKL063C	YKL063C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	IFM1	P25038	676 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	PHO89	P38361	574 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	FET3	P38993	636 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YOR114W	Q12219	294 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YPL247C	Q12523	523 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	ARN2	P38724	620 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	COG3	P40094	801 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	AIM20	P40451	204 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	DPP1	Q05521	289 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	DOA4	P32571	926 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	SWC4	P53201	476 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	ECM18	Q04623	453 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	APC9	Q12107	265 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	AEP1	P32493	518 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	LOA1	Q06508	300 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YPR064W	Q12492	139 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	ERG2	P32352	222 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	NAS2	P40555	220 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YJL016W	P47072	561 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	YPR1	Q12458	312 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	IZH4	Q99393	312 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	SWC5	P38326	303 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	KRE6	P32486	720 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	CAB5	Q03941	241 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YKL063C	YKL063C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	CSG2	P35206	410 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YHL026C	P38740	315 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YJL118W	P47022	219 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YML018C	Q03730	393 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	SMI1	P32566	505 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	AYR1	P40471	297 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	YMR209C	Q03648	457 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YKL063C	YKL063C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28

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