RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 EVI5O60447 810 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 SCP2P22307 547 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNA3P32297 505 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 SEPT6Q14141 434 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 GALCP54803 685 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 KRT7P08729 469 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 HPSEQ9Y251 543 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 ELF1P32519 619 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 CAP2P40123 477 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 MORC4Q8TE76 937 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF185O15231 689 aa22.04■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 MAFGO15525 162 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 RTN2O75298 545 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC39CQ8N584 583 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL29Q96CT2 875 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTPRJ-208ENST00000615445 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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PTPRJ-208ENST00000615445 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 IL1R1P14778 569 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOA4Q13772 614 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 PKN1Q16512 942 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.01■■□□□ 1.11
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