RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC25A	P30304	524 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NRIP1	P48552	1158 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TFF2	Q03403	129 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	HYI	Q5T013	277 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	BICD1	Q96G01	975 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PLIN2	Q99541	437 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FZD8	Q9H461	694 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	DPP7	Q9UHL4	492 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF10A	O00220	468 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM13A	O94988	1023 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00271	P0C7V0	271 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1G1	P47890	313 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIK3	Q13003	919 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	BECN1	Q14457	450 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ECM1	Q16610	540 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	EFHB	Q8N7U6	833 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GAD1	Q99259	594 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL14	O95715	111 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	UROD	P06132	367 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GALT	P07902	379 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PLS3	P13797	630 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MLH1	P40692	756 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NPTX2	P47972	431 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNQ1	P51787	676 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	IL17A	Q16552	155 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	UBXN11	Q5T124	520 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS52	Q8N1B4	723 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP10	Q92851	521 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	IGSF21	Q96ID5	467 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	STK17A	Q9UEE5	414 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CD207	Q9UJ71	328 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		12.46	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	B4GALT5	O43286	388 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TH	P07101	528 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP1	P13497	986 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP5	P24588	427 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PBX3	P40426	434 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SCNN1G	P51170	649 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CREM	Q03060	361 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	HYAL1	Q12794	435 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	REST	Q13127	1097 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	AMHR2	Q16671	573 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KYAT1	Q16773	422 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CES5A	Q6NT32	575 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MYCT1	Q8N699	235 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	BSND	Q8WZ55	320 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42

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