RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa17.67■□□□□ 0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPARCL1Q14515 664 aa17.67■□□□□ 0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPD1LQ8N335 351 aa17.66■□□□□ 0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2W6PQ8NHA6 318 aa17.66■□□□□ 0.42
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLIT3O75094 1523 aa17.64■□□□□ 0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXT2Q93063 718 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CREB3O43889 395 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARSP49589 748 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KITP10721 976 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNJ1P48048 391 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IZUMO3Q5VZ72 239 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REXO1L1PQ8IX06 675 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K14Q99558 947 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK13O15264 365 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPAG7O75391 227 aa17.64■□□□□ 0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCAR1P56945 870 aa17.64■□□□□ 0.41
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