RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 NAMPTP43490 491 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 ZP2Q05996 745 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 KRT79Q5XKE5 535 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 GJD3Q8N144 294 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 ZFP42Q96MM3 310 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 FAM50BQ9Y247 325 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 USP20Q9Y2K6 914 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 STK24Q9Y6E0 443 aa25.47■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 ARL5CA6NH57 179 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 NPTXRO95502 500 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 EYA4O95677 639 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 COASYQ13057 564 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 FAM187BQ17R55 369 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 VPS52Q8N1B4 723 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 ZBP1Q9H171 429 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 MIOSQ9NXC5 875 aa25.46■■□□□ 1.67
PSME4-208ENST00000481518 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 DEPTORQ8TB45 409 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.45■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 AKAP5P24588 427 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 SCNN1GP51170 649 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 DAW1Q8N136 415 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PNMA5Q96PV4 448 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 DNM3Q9UQ16 869 aa25.44■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PRKCBP05771 671 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 LIG1P18858 919 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PPP2R5AQ15172 486 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 MAPK6Q16659 721 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 KIFAP3Q92845 792 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 MARCH5Q9NX47 278 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 FSD2A1L4K1 749 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 CARNS1A5YM72 827 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 NRP1O14786 923 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 CXCL14O95715 111 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 CTSAP10619 480 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 DSC1Q08554 894 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 MAPK7Q13164 816 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 HYIQ5T013 277 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 KLK14Q9P0G3 267 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.42■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ACKR2O00590 384 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ALDH2P05091 517 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 CA8P35219 290 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 HACE1Q8IYU2 909 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 IFT74Q96LB3 600 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PLIN2Q99541 437 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.41■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 F8W810 466 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 HIP1RO75146 1068 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 BRAPQ7Z569 592 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 S1PR5Q9H228 398 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 PARP2Q9UGN5 583 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 IRAK3Q9Y616 596 aa25.4■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 N4BP3O15049 544 aa25.39■■□□□ 1.66
PSME4-208ENST00000481518 OR1G1P47890 313 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms