RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTHFRP42898 656 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A17Q8WUG5 538 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPOR3Q96MK2 946 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH6Q9H252 994 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF39Q9H2S5 420 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POMKQ9H5K3 350 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HES2Q9Y543 173 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL5CA6NH57 179 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPPL1O15357 1258 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLH1P40692 756 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN21Q16825 1174 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HACE1Q8IYU2 909 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAD1Q99259 594 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAEAQ7L5Y9 396 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NACC1Q96RE7 527 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOL6Q9BWW8 343 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALT5O43286 388 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED24O75448 989 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WEE2P0C1S8 567 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52Z1P0C646 297 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1G1P47890 313 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIGLEC14Q08ET2 396 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF174Q15697 407 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB33Q86T24 672 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABP7Q86V35 215 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COLGALT2Q8IYK4 626 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERMNQ8TAM6 284 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPRC5CQ9NQ84 441 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIT1Q9Y2X7 761 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRIQ4A6NIV6 560 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRC2P26717 231 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCNN1GP51170 649 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAT1Q5SQI0 421 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1841Q6NSI8 718 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KANK3Q6NY19 840 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC27A1Q6PCB7 646 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL18Q96ME1 805 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP42Q96MM3 310 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARCH5Q9NX47 278 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOD2P04179 222 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNPP09543 421 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSC1Q08554 894 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEGQ6S5H5 508 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIOSQ9NXC5 875 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GUA9 196 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2CD4DB7Z1M9 353 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRB3O75022 631 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR1I2O75469 434 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPTXRO95502 500 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URODP06132 367 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPA1P27694 616 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC38Q5R3I4 469 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2CD2LO14523 706 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP5P24588 427 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCN4P51793 760 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMC5Q6UXY8 1006 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOSTRINQ8IVI9 506 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFXN1Q9H9B4 322 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDFY4Q6ZS81 3184 aa29■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF35A5YM69 484 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL6Q8N531 539 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.99■■■□□ 2.23
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