RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 A0A0A6YYJ9 748 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 KLHL33A6NCF5 533 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 OPHN1O60890 802 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PFKMP08237 780 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 VCAM1P19320 739 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MAKP20794 623 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 AGXTP21549 392 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ACAP1Q15027 740 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 UGT8Q16880 541 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 USP30Q70CQ3 517 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 KCNK18Q7Z418 384 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 EXTL1Q92935 676 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 DYDC2Q96IM9 177 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 LMF1Q96S06 567 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 OR10A2Q9H208 303 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 USP18Q9UMW8 372 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 NR2E1Q9Y466 385 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGAP6O43182 974 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MTHFD2P13995 350 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 RAC3P60763 192 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC142Q17RM4 750 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CT83Q5H943 113 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 GNRHR2Q96P88 292 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 KIF3BO15066 747 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MAFGO15525 162 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 FOXS1O43638 330 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 RAMP2O60895 175 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ODF1Q14990 250 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TOR2AQ5JU69 321 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 FAM89AQ96GI7 184 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TEKT5Q96M29 485 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 WDR92Q96MX6 357 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 SOX7Q9BT81 388 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 VWA7Q9Y334 891 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.07□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 C2orf78A6NCI8 922 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MATN2O00339 956 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 LPLP06858 475 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 GPR15P49685 360 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MUM1Q2TAK8 710 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 ANO4Q32M45 955 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 CFHR4Q92496 578 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 JADE3Q92613 823 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.06□□□□□ -1.76
CCDC82-202ENST00000423339 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms