RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378863.8

CRLS1-201, Transcript of cardiolipin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRLS1, Length 3,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1-201ENST00000378863 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 Q4G0T1 1027 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 LIN9Q5TKA1 542 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 RNF14Q9UBS8 474 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 A0A1W2PQJ5 194 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ITGA4P13612 1032 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 NAB2Q15742 525 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 CREG2Q8IUH2 290 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ANKS4BQ8N8V4 417 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15.77■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 VWA5AO00534 786 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 NPTX2P47972 431 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 RIT2Q99578 217 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 STAT5BP51692 787 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 MTMR3Q13615 1198 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 PGM5Q15124 567 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ALS2CLQ60I27 953 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SPATA33Q96N06 139 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 NID2Q14112 1375 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 MEA1Q16626 185 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SGO2Q562F6 1265 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 KRT39Q6A163 491 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 PAF1Q8N7H5 531 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 NLRP7Q8WX94 980 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 CDHR1Q96JP9 859 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 CCDC77Q9BR77 488 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 NUP85Q9BW27 656 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 RAB21Q9UL25 225 aa15.76■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 PSMD10O75832 226 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.114e-7■□□□□ 9
CRLS1-201ENST00000378863 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SEL1LQ9UBV2 794 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TJP1Q07157 1748 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 COL4A1P02462 1669 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SGPL1O95470 568 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 CDO1Q16878 200 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ZBTB10Q96DT7 871 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 IRAK1P51617 712 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 WDR93Q6P2C0 686 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 WHAMMQ8TF30 809 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 PXMP2Q9NR77 195 aa15.75■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 KRT15P19012 456 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 WEE2P0C1S8 567 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 AMPD2Q01433 879 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 LY6KQ17RY6 165 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 FAM83AQ86UY5 434 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 AGPAT1Q99943 283 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.74■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.73■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 GAS8O95995 478 aa15.73■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 LRRC14Q15048 493 aa15.73■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.73■□□□□ 0.11
CRLS1-201ENST00000378863 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms