RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 SCTRP47872 440 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 FAM153CQ494X1 144 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PPM1NQ8N819 430 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ING2Q9H160 280 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PALMDQ9NP74 551 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ARL4CP56559 192 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 C9orf72Q96LT7 481 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.55■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 NR3C1P04150 777 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 GAP43P17677 238 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 GPC5P78333 572 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SLC18A3Q16572 532 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TEX9Q8N6V9 391 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 NPHS2Q9NP85 383 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SLIT1O75093 1534 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 KDM1AO60341 852 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ENO1P06733 434 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 AMNQ9BXJ7 453 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 VCPKMTQ9H867 229 aa16.54■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM120BA0PK00 339 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 RAPGEF5Q92565 580 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 HESX1Q9UBX0 185 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 AKR1B1P15121 316 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PARVGQ9HBI0 331 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 A6NJR5 290 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 CAPN9O14815 690 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SLC37A4O43826 429 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 CNGA3Q16281 694 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 KCTD6Q8NC69 237 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 RNF169Q8NCN4 708 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 RUBCNQ92622 972 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 FGFR2P21802 821 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 LAMB3Q13751 1172 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TRIP10Q15642 601 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 MED15Q96RN5 788 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 RGL1Q9NZL6 768 aa16.53■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TRABDQ9H4I3 376 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ADA2Q9NZK5 511 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 FANCGO15287 622 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 MARK3P27448 753 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 POLD1P28340 1107 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 GCLMP48507 274 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 THTPAQ9BU02 230 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 SPC25Q9HBM1 224 aa16.52■□□□□ 0.24
KCNS1-201ENST00000306117 EPHB6O15197 1021 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 LPXNO60711 386 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC22O60826 627 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KRT38O76015 456 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SLC20A2Q08357 652 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 GPS1Q13098 491 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 HIC1Q14526 733 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms