RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 CXorf38Q8TB03 319 aa6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 JDP2Q8WYK2 163 aa6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CFHR4Q92496 578 aa6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 HDAC10Q969S8 669 aa6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.31□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 TEX33O43247 280 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PCDHGA12O60330 932 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 TMEM127O75204 238 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 RFPL1O75677 317 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 RAD17O75943 681 aa6.3□□□□□ -1.4
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CSN3-201ENST00000304954 PER3P56645 1201 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 MST1LQ2TV78 715 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 TLR9Q9NR96 1032 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 DNM3Q9UQ16 869 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.3□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 MATN2O00339 956 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 IL33O95760 270 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ITGB3P05106 788 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CYP2C19P33261 490 aa6.29□□□□□ -1.4
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CSN3-201ENST00000304954 CTSWP56202 376 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ATP2B3Q16720 1220 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 OR7D4Q8NG98 312 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 IL17RAQ96F46 866 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 BORCS6Q96GS4 357 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 SAMD11Q96NU1 681 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 GPHA2Q96T91 129 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CDH19Q9H159 772 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ING3Q9NXR8 418 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 NCDNQ9UBB6 729 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.29□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 CYP27B1O15528 508 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 AKAP10O43572 662 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 MFAP3LO75121 409 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ABLIM3O94929 683 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 IL2RBP14784 551 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 C5AR1P21730 350 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ADAM8P78325 824 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PTH1RQ03431 593 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 GRM7Q14831 915 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 NOMO1Q15155 1222 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 FAM89AQ96GI7 184 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 LANCL2Q9NS86 450 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 TMEM140Q9NV12 185 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 EID1Q9Y6B2 187 aa6.28□□□□□ -1.4
CSN3-201ENST00000304954 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 UBE2QL1A1L167 161 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 K7ESM1 405 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 SGTAO43765 313 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 ITGA10O75578 1167 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 RAB27AP51159 221 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 GTF2H3Q13889 308 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 PPP2R5AQ15172 486 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 PPM1NQ8N819 430 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 COA7Q96BR5 231 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 OR14A2Q96R54 314 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 EPC1Q9H2F5 836 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.27□□□□□ -1.41
CSN3-201ENST00000304954 INTUQ9ULD6 942 aa6.27□□□□□ -1.41
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