RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN21Q16825 1174 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PHKA2P46019 1235 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 STRN3Q13033 797 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 AMHR2Q16671 573 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB33Q86T24 672 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 FZD8Q9H461 694 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CBFA2T2O43439 604 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PTK7Q13308 1070 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ADAM9Q13443 819 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SNX17Q15036 470 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 MAPK6Q16659 721 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SAAL1Q96ER3 474 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PDXKO00764 312 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 NR3C1P04150 777 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 NR2F2P24468 414 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TLE2Q04725 743 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CD4P01730 458 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 CKBP12277 381 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 LIG4P49917 911 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 MGAT3Q09327 533 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TSG101Q99816 390 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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PRRT1-201ENST00000211413 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM206Q9H813 350 aa20.33■□□□□ 0.84
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PRRT1-201ENST00000211413 BICDL2A1A5D9 508 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 KIF20AO95235 890 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 EFNA5P52803 228 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ALCAMQ13740 583 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF410Q86VK4 478 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 NME8Q8N427 588 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 NRDCO43847 1150 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TSPAN1O60635 241 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP3O75969 853 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 GHRP10912 638 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 UBASH3AP57075 661 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC63Q05C16 580 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 FAAP100Q0VG06 881 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 FAM84AQ96KN4 292 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 UBE4BO95155 1302 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ACKR2O00590 384 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF18P17022 549 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R2P41236 205 aa20.31■□□□□ 0.84
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PRRT1-201ENST00000211413 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 MBTPS1Q14703 1052 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 RSPH3Q86UC2 560 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 FAM228AQ86W67 206 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 CEP120Q8N960 986 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 TCHPQ9BT92 498 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT1-201ENST00000211413 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.31■□□□□ 0.84
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