RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100164.4

Hoxc4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc4, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Fam81aQ3UXZ6 364 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Dph1Q5NCQ5 438 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Vav2Q60992 868 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Gstt2Q61133 244 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Lca5Q80ST9 704 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Anapc5Q8BTZ4 740 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Apol9bQ8C7I4 310 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Apol9aQ8VDU3 310 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Spc24Q9D083 201 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Prss23Q9D6X6 382 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Znf654Q9DAU9 571 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rsc1a1Q9ER99 582 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sertad1Q9JL10 236 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cyth1Q9QX11 398 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Fam71e2L7N480 754 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Akr1b8P45377 316 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Slc1a1P51906 523 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 AaasP58742 546 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Tbc1d10aP58802 500 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Ezh1P70351 747 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Znf667Q2TL60 609 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 MlxipQ2VPU4 917 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 KizQ3UXL4 695 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Dhx37Q6NZL1 1150 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Spata24Q6P926 205 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sestd1Q80UK0 696 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Bank1Q80VH0 783 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Zfp120Q8BZW4 436 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sh3rf3Q8C120 878 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rab44Q8CB87 725 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Hectd2Q8CDU6 774 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 MlxiplQ99MZ3 864 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Inpp4aQ9EPW0 939 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cul3Q9JLV5 768 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Gm5737A0A140LI11 423 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rfx8D3YU81 596 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sclt1G5E861 688 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Aff1O88573 1216 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rb1P13405 921 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Fgfr1P16092 822 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Eno1P17182 434 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Palb2Q3U0P1 1104 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rsad1Q5SUV1 442 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Mks1Q5SW45 561 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Zbtb17Q60821 794 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Atp4aQ64436 1033 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Kcnk18Q6VV64 394 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Gjd4Q8BSD4 364 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sec14l2Q99J08 403 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sugt1Q9CX34 336 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Dynll2Q9D0M5 89 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rtn3Q9ES97 964 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Homer1Q9Z2Y3 366 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Zfp831A2ADM8 1628 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Bpifb9bA2AJD1 591 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Zfp105G3X9I0 524 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Ccdc127Q3TC33 260 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cdcp1Q5U462 833 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rasa3Q60790 834 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Sec23ipQ6NZC7 998 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Ano5Q75UR0 904 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Ints2Q80UK8 1198 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Bpifb9aQ80XI7 591 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 GlmnQ8BZM1 596 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Zfp449Q8CB76 518 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cys1Q8R4T1 145 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Rpap2Q8VC34 614 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Tti1Q91V83 1085 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Fam192aQ91WE2 254 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Hars2Q99KK9 505 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Gdap2Q9DBL2 498 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Ccdc97Q9DBT3 340 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Nudt12Q9DCN1 462 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Klrc2Q9WTJ9 238 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Hao1Q9WU19 370 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Kcng1A2BDX4 514 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cfap221A9Q751 836 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Olfr310B2RVZ1 332 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Gm4297D3YWB7 211 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 PtpreP49446 699 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Dcaf17Q3TUL7 519 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Ogfod1Q3U0K8 545 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Bpifb5Q3UQ05 490 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Cnga4Q3UW12 575 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxc4-201ENSMUST00000100164 Krt31Q61765 416 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.4 ms