RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFIAQ12857 509 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOGQ13253 232 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AOC3Q16853 763 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR16Q569H4 304 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL31RAQ8NI17 732 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC35A4Q96G79 324 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCOCQ9UIL1 159 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PPL8 197 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC16A6O15403 523 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPIG6BO95866 241 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BRAFP15056 766 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTGS1P23219 599 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A1P30825 629 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HK3P52790 923 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP3CAQ08209 521 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPFIA1Q13136 1202 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IKZF1Q13422 519 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMTC2Q8N394 836 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF527Q8NB42 609 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NETO2Q8NC67 525 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CALML6Q8TD86 181 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBATAQ96M53 351 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEUROD6Q96NK8 337 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPA4Q9UI42 421 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP83Q9Y592 693 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYTNA2CJ06 578 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F8W8V4 182 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOL1O14791 398 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGF18O76093 207 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOBTB3O94955 611 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL18RAPO95256 599 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PYGLP06737 847 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FUT4P22083 530 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CASP2P42575 452 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP4F8P98187 520 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DAG1Q14118 895 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLS1Q14651 629 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MZT2AQ6P582 158 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMC6Q7Z403 805 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C3orf20Q8ND61 904 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKS1AQ92625 1134 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPN18Q99952 460 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMNQ9BXJ7 453 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAFGO15525 162 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMARCA1P28370 1054 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THBS2P35442 1172 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDIT3P35638 169 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD96P40200 585 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPA7P48741 367 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms