RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	NR3C1	P04150	777 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TPM3	P06753	285 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	NR2F2	P24468	414 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ACLY	P53396	1101 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	UBASH3A	P57075	661 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	IGBP1	P78318	339 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	STRN3	Q13033	797 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	HIC1	Q14526	733 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT31	Q15323	416 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPF	P49454	3210 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR32	O75388	356 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINC1	P01008	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP2C9	P11712	490 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ADSS	P30520	456 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PHKA2	P46019	1235 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GPC3	P51654	580 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CLCN3	P51790	818 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK6	Q16659	721 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	DNM1L	O00429	736 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TREH	O43280	583 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TOM1L1	O75674	476 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	AKAP3	O75969	853 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	SGPL1	O95470	568 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	PBX1	P40424	430 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0B4J269	797 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PQC6	194 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	CLIC2	O15247	247 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	PMM2	O15305	246 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	CAND2	O75155	1236 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TPM2	P07951	284 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	PROZ	P22891	400 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A087WZ62	844 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	ABLIM1	O14639	778 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	N4BP3	O15049	544 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	LIG4	P49917	911 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK7	P50613	346 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	MCL1	Q07820	350 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	PTK7	Q13308	1070 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	AMHR2	Q16671	573 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRAF4-208	ENST00000469529	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18

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