RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 BAG3O95817 575 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 LDHCP07864 332 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 MUTP22033 750 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf91Q3C1V1 193 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS1R3Q7RTX0 852 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS4Q9BTZ2 278 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 NYXQ9GZU5 481 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 PSME4Q14997 1843 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG7O95352 703 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNE2O96020 404 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT88Q13099 833 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TAZQ16635 292 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC9Q7Z3E5 817 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CALML4Q96GE6 196 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM4CQ9H3R0 1056 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 RIPK2O43353 540 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCG2P16885 1265 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV4P43268 484 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2BQ00403 316 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ECHDC2Q86YB7 292 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC45Q96CN5 670 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.93□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ABLIM1O14639 778 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 MIEF2Q96C03 454 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 DONSONQ9NYP3 566 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM22Q9P0K1 906 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 APEX2Q9UBZ4 518 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TYROBPO43914 113 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP104O60308 925 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 PAFAH1B1P43034 410 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF9Q3BBW0 867 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 LLGL2Q6P1M3 1020 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 SETDB2Q96T68 719 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM117Q9H0C3 514 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM182BQ5T319 152 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 SP8Q8IXZ3 490 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 FAM107BQ9H098 131 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 GSRP00390 522 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B4P51659 736 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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