RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	ATP5	P09457	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MSN1	P22148	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	PBN1	P25580	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YKL075C	P36083	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	LDH1	P38139	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	CHL4	P38907	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YIL024C	P40543	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RIM8	P53179	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SKO1	Q02100	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ATG10	Q07879	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	TMS1	Q12116	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	TRM13	Q12383	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RMD5	Q12508	421 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	AAC1	P04710	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	GCR1	P07261	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SGF29	P25554	259 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	GCS1	P35197	352 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MUP3	P38734	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YHR035W	P38769	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SHO1	P40073	367 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SLZ1	P40167	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	POG1	P40473	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	DSD1	P53095	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YNL140C	P53910	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RIF2	Q06208	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ACM1	Q08981	209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	GPM2	Q12008	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	COX5B	P00425	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RHO2	P06781	192 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	PHO2	P07269	559 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SAG1	P20840	650 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	STP22	P25604	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	PCL2	P25693	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	TRK2	P28584	889 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	STE14	P32584	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	TRS65	P32893	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SLC1	P33333	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YKL070W	P36087	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	EHT1	P38295	451 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SPG5	P42933	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	GAT1	P43574	510 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	GWT1	P47026	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	TAX4	P47030	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	DIA3	P52290	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YGL101W	P53144	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YNL260C	P53846	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	DPP1	Q05521	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	EST2	Q06163	884 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YET3	Q07451	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	JLP1	Q12358	412 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	ELO2	P25358	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
CYK3	YDL117W	FRE2	P36033	711 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	GEP4	P38812	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YGR151C	P53287	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	TPO1	Q07824	586 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	QCR7	P00128	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YCL002C	P25565	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SNC1	P31109	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MRPL36	P36531	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YBR053C	P38235	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MMS21	P38632	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YJL171C	P46992	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	IRC8	P47046	822 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	DAN1	P47178	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	YGL235W	P53071	178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	VPS28	Q02767	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	SRT1	Q03175	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	RNH202	Q05635	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	CUR1	Q06469	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	MED7	Q08278	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CYK3	YDL117W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
CYK3	YDL117W	RDR1	Q08904	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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