RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.65□□□□□ -1.34
TRDN-204ENST00000542443 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PRSS38A1L453 326 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MUSKO15146 869 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 APOL3O95236 402 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 GPR3P46089 330 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 BCAR1P56945 870 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ANO3Q9BYT9 981 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 KATNBL1Q9H079 304 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 VPS11Q9H270 941 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TNKSO95271 1327 aa6.64□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TRIM75PA6NK02 468 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SYNJ1O43426 1573 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FOXS1O43638 330 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ENPP1P22413 925 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 GDF5P43026 501 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 RRADP55042 308 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MAP3K1Q13233 1512 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 HS1BP3Q53T59 392 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CT83Q5H943 113 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ODR4Q5SWX8 454 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 WDR48Q8TAF3 677 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FERMT2Q96AC1 680 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.63□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SHTN1A0MZ66 631 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FZD9O00144 591 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PFKMP08237 780 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 POLD1P28340 1107 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CD83Q01151 205 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 Q8N1X5 172 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ZNF747Q9BV97 191 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PRXQ9BXM0 1461 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MYPNQ86TC9 1320 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 A0A0A6YYJ9 748 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MT-CO1P00395 513 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CFBP00751 764 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MYBL2P10244 700 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 RBP3P10745 1247 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 NEK2P51955 445 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 RAC3P60763 192 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MCL1Q07820 350 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 UGT8Q16880 541 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 MTG2Q9H4K7 406 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 FBXO10Q9UK96 956 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.61□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 CUTAO60888 179 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 OPHN1O60890 802 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 EPHB1P54762 984 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 KRT85P78386 507 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PTPN21Q16825 1174 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 KCNK18Q7Z418 384 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.6□□□□□ -1.35
TRDN-204ENST00000542443 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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