RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PRKCEQ02156 737 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 INHBEP58166 350 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MYL7Q01449 175 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SP4Q02446 784 aa8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 XKR3Q5GH77 459 aa8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.92□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FERP16591 822 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ATP4AP20648 1035 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CNGA1P29973 690 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DLG4P78352 724 aa8.92□□□□□ -0.98
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