RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	MYADML2	A6NDP7	307 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC169	A6NNP5	214 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC16A4	O15374	487 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	AP5Z1	O43299	807 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PGK1	P00558	417 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MYL3	P08590	195 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CCL5	P13501	91 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PTEN	P60484	403 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM9	Q13443	819 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TFDP1	Q14186	410 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	RPAIN	Q86UA6	219 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF208	Q9H0X6	261 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	DENND3	A2RUS2	1198 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529		K7ENM7	598 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CETN3	O15182	167 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK13	O15264	365 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ASGR1	P07306	291 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FANCC	Q00597	558 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ENPEP	Q07075	957 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNA1	Q09470	495 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPS	Q13938	189 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNA10	Q16322	511 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM187B	Q17R55	369 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF410	Q86VK4	478 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FZD8	Q9H461	694 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SETD4	Q9NVD3	440 aa		14	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GTH6	734 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529		K7ERI5	159 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ADCY5	O95622	1261 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GJB1	P08034	283 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC25B	P30305	580 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	DRP2	Q13474	957 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	NR1I3	Q14994	352 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GART	P22102	1010 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	GJA8	P48165	433 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF75D	P51815	510 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17	3e-6	■■■■□ 24
TRAF4-208	ENST00000469529	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRAF4-208	ENST00000469529	ACKR2	O00590	384 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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