RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF25Q93038 417 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM143Q96AN5 459 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYDC2Q96IM9 177 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT122Q9HBG6 1241 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM105AQ9NUU6 356 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIDE1A8MVS5 230 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB27AP51159 221 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCAR1P56945 870 aa29.27■■■□□ 2.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK4P51957 841 aa29.26■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4A11Q02928 519 aa29.26■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKR9Q5GH70 373 aa29.26■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLB1LQ6UWU2 654 aa29.26■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa29.26■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUTYHQ9UIF7 546 aa29.26■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.25■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF623O75123 536 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNC3Q14003 757 aa29.25■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCP11Q8WWU5 503 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TECP42680 631 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM29Q14134 588 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMC2Q15006 297 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LLGL2Q6P1M3 1020 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPH2Q8IWU9 490 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGBD4Q96DM1 585 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM169Q96HH4 297 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARNS1A5YM72 827 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTBD18B2RXH4 712 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC730098B7Z3J9 87 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB39O15060 712 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASAP2O43150 1006 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAK2O60674 1132 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOSBP53539 338 aa29.23■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.23■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D13Q9NVG8 400 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLITRK3O94933 977 aa29.22■■■□□ 2.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FERMT3Q86UX7 667 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUSD6Q92537 303 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTRQ99707 1265 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MINDY3Q9H8M7 445 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIOO75962 3097 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf71A6NGG8 1288 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OFD1O75665 1012 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA8P35219 290 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF149Q8NC42 400 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S1PR5Q9H228 398 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID2Q68CP9 1835 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEMFO60524 1076 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP10Q92851 521 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCL14O95715 111 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCE2Q6PIF2 218 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS52Q8N1B4 723 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URGCPQ8TCY9 931 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOL5Q9BWW9 433 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBP3Q9H0R5 595 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYPLA2O95372 231 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALTP07902 379 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXKP42681 527 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDAQ92838 391 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF21Q96ID5 467 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKEF1Q9NU02 776 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa29.18■■■□□ 2.26
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