RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ACVR2BQ13705 512 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC41Q15345 812 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNK18Q7Z418 384 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 JAMLQ86YT9 394 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 RELL1Q8IUW5 271 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX9Q8N6V9 391 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP120Q8N960 986 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 FBF1Q8TES7 1133 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 HPS3Q969F9 1004 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MRIQ9BWK5 157 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 AMNQ9BXJ7 453 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 ANO3Q9BYT9 981 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM206Q9H813 350 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 EBF2Q9HAK2 575 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 NYAP2Q9P242 653 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 AMACRQ9UHK6 382 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 GGA1Q9UJY5 639 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 COL4A1P02462 1669 aa8.34□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM22K7EJ46 135 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RASGRF2O14827 1237 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RTN2O75298 545 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM13AO94988 1023 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V1G2O95670 118 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GAS8O95995 478 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ALAS1P13196 640 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TM4SF1P30408 202 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FMO5P49326 533 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNG1P51959 295 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RHBDL3P58872 404 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GPC5P78333 572 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP4P98171 946 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP11AP98196 1134 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ARID5AQ03989 594 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 KLRC3Q07444 240 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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CAPNS1-202ENST00000586851 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GPATCH11Q8N954 259 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 BORCS6Q96GS4 357 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GMCL1Q96IK5 515 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SYT11Q9BT88 431 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 COA1Q9GZY4 146 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PARVGQ9HBI0 331 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CD209Q9NNX6 404 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SIX2Q9NPC8 291 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM260Q9NX78 707 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ASTN1O14525 1302 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF1P21675 1872 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 POTEB3A0JP26 581 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 POTECB2RU33 542 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 E9PMD0 336 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 THAP12O43422 761 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SNX3O60493 162 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 AKAP3O75969 853 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GCNT3O95395 438 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ECEL1O95672 775 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD2P08910 425 aa8.32□□□□□ -1.08
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