RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 GDAP1Q8TB36 358 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF570Q96NI8 536 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 SETDB2Q96T68 719 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB34Q9BZG1 259 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.41□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ESYT2A0FGR8 921 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 VCAM1P19320 739 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRKCIP41743 596 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP2R5AQ15172 486 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 KAT5Q92993 513 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 BORCS6Q96GS4 357 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALG6Q9Y672 507 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC188H7C350 402 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACSL3O95573 720 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNA14O95837 355 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 PYGMP11217 842 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPSM2P81274 684 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 MGAT5Q09328 741 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 BARGINQ6ZT62 677 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPAINQ86UA6 219 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERICH1Q86X53 443 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYP4X1Q8N118 509 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC63Q8NA47 563 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRPC6Q9Y210 931 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 DIAPH2O60879 1101 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHRNB2P17787 502 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CACNB3P54284 484 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF543Q08ER8 600 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNGA2Q16280 664 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 USH1GQ495M9 461 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 HYIQ5T013 277 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 FITM2Q8N6M3 262 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM84AQ96KN4 292 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.4□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 MEIS2O14770 477 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNHG28P0DPA3 235 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CETPP11597 493 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHKAP35790 457 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYP2J2P51589 502 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCALDP61601 193 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAPK7Q13164 816 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTMR3Q13615 1198 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 DENND2CQ68D51 928 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 CGB2Q6NT52 195 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms