RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 ARID2Q68CP9 1835 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 LINC00271P0C7V0 271 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 RPA1P27694 616 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 FERMT3Q86UX7 667 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 NACC1Q96RE7 527 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 CHST12Q9NRB3 414 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 DACT1Q9NYF0 836 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.7■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 LAD1O00515 517 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 RB1P06400 928 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PTPROQ16827 1216 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 POTEGQ6S5H5 508 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 RAB34Q9BZG1 259 aa26.69■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 FGFR1P11362 822 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PDIA5Q14554 519 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 RNF149Q8NC42 400 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 RNF169Q8NCN4 708 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 THEGQ9P2T0 379 aa26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PLVAPQ9BX97 442 aa26.67■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0U1RQF3 1178 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 HOXA2O43364 376 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PRPHP41219 470 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PHKA2P46019 1235 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 TFDP1Q14186 410 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 STK24Q9Y6E0 443 aa26.66■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 MUTP22033 750 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 ARL2P36404 184 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 ABI1Q8IZP0 508 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.65■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 REV3LO60673 3130 aa26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 EOMESO95936 686 aa26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 PDCP20941 246 aa26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SMKR1-201ENST00000462322 GRM6O15303 877 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 IL17AQ16552 155 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ECM1Q16610 540 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 KRT79Q5XKE5 535 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 P2RX5Q93086 422 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 RNF19AQ9NV58 838 aa26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.63■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 SKIP12755 728 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 GLRA2P23416 452 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 PTENP60484 403 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 CAPSQ13938 189 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 TIGD5Q53EQ6 642 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 PADI6Q6TGC4 694 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 BRAPQ7Z569 592 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 CASD1Q96PB1 797 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 LMAN2LQ9H0V9 348 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 AAASQ9NRG9 546 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.62■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 PP2D1A8MPX8 630 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ERLIN2O94905 339 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 POU5F1BQ06416 359 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.61■■□□□ 1.85
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