RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 IMPDH2P12268 514 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CYP11B2P19099 503 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 STK4Q13043 487 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 VSTM4Q8IW00 320 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 COG1Q8WTW3 980 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 STX17P56962 302 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 NR1I3Q14994 352 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TREML2Q5T2D2 321 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 NAA35Q5VZE5 725 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 NSMFQ6X4W1 530 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC65Q8IXS2 484 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 IL31RAQ8NI17 732 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 FAM81AQ8TBF8 368 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 POTEFA5A3E0 1075 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 LINGO3P0C6S8 592 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 POTEIP0CG38 1075 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CCND2P30279 289 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 COPB2P35606 906 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TTI2Q6NXR4 508 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 POTEGQ6S5H5 508 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 POTEEQ6S8J3 1075 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 VSIG10LQ86VR7 867 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 RIOX2Q8IUF8 465 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 P2RX5Q93086 422 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GPRASP2Q96D09 838 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 BICD1Q96G01 975 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM4Q9C037 500 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 KCND2Q9NZV8 630 aa16■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SLITRK3O94933 977 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SLC8A1P32418 973 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 MTMR1Q13613 665 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CENPPQ6IPU0 288 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GPBP1Q86WP2 473 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 OTUD5Q96G74 571 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 PIDD1Q9HB75 910 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SMIM24O75264 130 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ATP6V1G1O75348 118 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 FKBP1BP68106 108 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GUCY1A3Q02108 690 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 DYMQ7RTS9 669 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 IWS1Q96ST2 819 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 UNC45AQ9H3U1 944 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 BATF3Q9NR55 127 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 PANK4Q9NVE7 773 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 PFASO15067 1338 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ABL1P00519 1130 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 COASYQ13057 564 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 DBN1Q16643 649 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 DNERQ8NFT8 737 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TSC22D3Q99576 134 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 INTS13Q9NVM9 706 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 DNM1LO00429 736 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 RNF8O76064 485 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 FCER1AP12319 257 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ARSHQ5FYA8 562 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 NLRX1Q86UT6 975 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 SLC35F6Q8N357 371 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM58Q8NG06 486 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 RDM1Q8NG50 284 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 ARL8AQ96BM9 186 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 NACC1Q96RE7 527 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 AHCYL1O43865 530 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 FESP07332 822 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC63Q05C16 580 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 MOGSQ13724 837 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA3-201ENST00000317201 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.5 ms