RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 IGFBP4P22692 258 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PADI6Q6TGC4 694 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 KCNK18Q7Z418 384 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 C9IYK1 514 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 CDC42EP1Q00587 391 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 CAPSQ13938 189 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 RNF169Q8NCN4 708 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 DGKIO75912 1065 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 GLRA2P23416 452 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ARL2P36404 184 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PKP1Q13835 747 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PNMA5Q96PV4 448 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 FGFR1P11362 822 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PTPAQ15257 358 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 PPM1EQ8WY54 764 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ASAP2O43150 1006 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 STAG3L1P0CL83 205 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 LONRF3Q496Y0 759 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 SPECC1Q5M775 1068 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 FIBCD1Q8N539 461 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 BSNDQ8WZ55 320 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 USP28Q96RU2 1077 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 DNM3Q9UQ16 869 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 TRANK1O15050 2925 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-201ENST00000279387 CYP11B2P19099 503 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 MUTP22033 750 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 PHKA2P46019 1235 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 ERVK-21P61565 698 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 GRB10Q13322 594 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 CABP7Q86V35 215 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 STK24Q9Y6E0 443 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 BMP15O95972 392 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 HCSTQ9UBK5 93 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 EYA4O95677 639 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 PTENP60484 403 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 TFDP1Q14186 410 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 CLIC6Q96NY7 704 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 FAM189BP81408 668 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 EPC2Q52LR7 807 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 CSRNP2Q9H175 543 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 UBA7P41226 1012 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 USP49Q70CQ1 688 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 TMEM192Q8IY95 271 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 LRRC15Q8TF66 581 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-201ENST00000279387 CPB2Q96IY4 423 aa26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms