RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221448.9

SNRNP70-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNRNP70, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70-201ENST00000221448 CSF2RAP15509 400 aa24.95■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 DRC1Q96MC2 740 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 USP25Q9UHP3 1055 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.95■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 GHRP10912 638 aa24.94■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 TRIM9Q9C026 710 aa24.94■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.94■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 MYCT1Q8N699 235 aa24.93■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 PRR29P0C7W0 189 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 ACRP10323 421 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 FGFR4P22455 802 aa24.92■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 CDC42EP1Q00587 391 aa24.92■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 LPIN1Q14693 890 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 ZNF410Q86VK4 478 aa24.92■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.92■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SNRNP70-201ENST00000221448 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.91■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNRNP70-201ENST00000221448 SLC16A4O15374 487 aa24.89■■□□□ 1.57
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SNRNP70-201ENST00000221448 ZNF131P52739 623 aa24.89■■□□□ 1.57
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SNRNP70-201ENST00000221448 FAM228AQ86W67 206 aa24.89■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 SFR1Q86XK3 245 aa24.89■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.89■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 PADI3Q9ULW8 664 aa24.89■■□□□ 1.57
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SNRNP70-201ENST00000221448 RFC2P35250 354 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 EPHB4P54760 987 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 PNOCQ13519 176 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 TCTN1Q2MV58 587 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 GPT2Q8TD30 523 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 HPS3Q969F9 1004 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 TIGD1Q96MW7 591 aa24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 PAK2Q13177 524 aa24.87■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.573e-15■■□□□ 13.8
SNRNP70-201ENST00000221448 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 KANK3Q6NY19 840 aa24.87■■□□□ 1.57
SNRNP70-201ENST00000221448 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.87■■□□□ 1.57
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