RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055562.2

Hoxc12-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc12, Length 1,031 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ccer2J3QPU5 274 aa28.16■■■□□ 2.1
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa28.15■■■□□ 2.1
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Plch2A2AP18 1501 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ssh2Q5SW75 1423 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Clstn2Q9ER65 966 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dip2aQ8BWT5 1523 aa28.11■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Abca17E9PX95 1733 aa28.09■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rsph4aQ8BYM7 716 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Naip6Q9JIB6 1403 aa28.05■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gli2Q0VGT2 1544 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pip4k2bQ80XI4 416 aa28.04■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 AlkP97793 1621 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Trpm2Q91YD4 1506 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dip2bQ3UH60 1574 aa28.03■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Uggt2E9Q4X2 1504 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.02■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Bcl9Q9D219 1425 aa28.01■■■□□ 2.08
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ube2uB1AUC4 352 aa28.01■■■□□ 2.07
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Scn4aQ9ER60 1841 aa27.99■■■□□ 2.07
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Kif3bQ61771 747 aa27.98■■■□□ 2.07
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Topaz1E5FYH1 1653 aa27.96■■■□□ 2.07
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Map4P27546 1125 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 ShprhQ7TPQ3 1674 aa27.9■■■□□ 2.06
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pde4cQ3UEI1 686 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Knl1Q66JQ7 1612 aa27.88■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Zfp644E9QA22 1323 aa27.87■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Robo2Q7TPD3 1470 aa27.85■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ncoa1P70365 1447 aa27.84■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa27.84■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa27.84■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 RictorQ6QI06 1708 aa27.83■■■□□ 2.05
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Mphosph9A6H5Y1 991 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 PtprgQ05909 1442 aa27.82■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gm13697A2AK42 830 aa27.81■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ecm2Q5FW85 670 aa27.81■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Nsd2Q8BVE8 1365 aa27.81■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Myo5cE9Q1F5 1742 aa27.81■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ttll5Q8CHB8 1328 aa27.8■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Naip5Q9R016 1403 aa27.79■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa27.77■■■□□ 2.04
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Myom3A2ABU4 1439 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Kif21bQ9QXL1 1668 aa27.75■■■□□ 2.03
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cd109Q8R422 1442 aa27.73■■■□□ 2.03
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Asxl1P59598 1514 aa27.72■■■□□ 2.03
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa27.71■■■□□ 2.03
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Trak1Q6PD31 939 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Adamts7Q68SA9 1657 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 NefmP08553 848 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Prex1Q69ZK0 1650 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rapgef3Q8VCC8 918 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 AnkarA2RT91 1465 aa27.65■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa27.64■■■□□ 2.02
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ttc21bQ0HA38 1315 aa27.64■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Hspa1lP16627 641 aa27.62■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pkd2O35245 966 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Iqsec2Q5DU25 1478 aa27.61■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 GapdhsQ64467 440 aa27.6■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Hfm1D3Z4R1 1434 aa27.59■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Abcc6Q9R1S7 1498 aa27.59■■■□□ 2.01
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tarbp1E9Q368 1579 aa27.56■■■□□ 2
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Atp7aQ64430 1491 aa27.56■■■□□ 2
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa27.56■■■□□ 2
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Akap12Q9WTQ5 1684 aa27.56■■■□□ 2
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gli3Q61602 1583 aa27.52■■■□□ 2
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Tecpr2Q3UH45 1423 aa27.51■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa27.5■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Eid3Q3V124 375 aa27.49■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Pik3c2gO70167 1506 aa27.49■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Cypt1Q8CH20 168 aa27.48■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 PzpQ61838 1495 aa27.47■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rims2Q9EQZ7 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Ino80Q6ZPV2 1559 aa27.45■■□□□ 1.99
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Iqgap3F8VQ29 1632 aa27.45■■□□□ 1.98
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Rock1P70335 1354 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Uggt1Q6P5E4 1551 aa27.42■■□□□ 1.98
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Dot1lQ6XZL8 1540 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxc12-201ENSMUST00000055562 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.3 ms