RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTGF	P29279	349 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRT2	P35908	639 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADH7	P40394	386 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	GSK3A	P49840	483 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	AP3B2	Q13367	1082 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2S	Q16763	222 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	BLID	Q8IZY5	108 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBC1D5	Q92609	795 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFRSF25	Q93038	417 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	AIFM3	Q96NN9	605 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	RMDN3	Q96TC7	470 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	GABRQ	Q9UN88	632 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	UST	Q9Y2C2	406 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	CFAP69	A5D8W1	941 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADCY3	O60266	1144 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	SASH3	O75995	380 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	HOXC6	P09630	235 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF76	P36508	570 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PEX19	P40855	299 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSD17B4	P51659	736 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBXN2A	P68543	259 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	GUCY1B3	Q02153	619 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNTN2	Q02246	1040 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRT40	Q6A162	431 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	MCTP1	Q6DN14	999 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM210A	Q96ND0	272 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	IWS1	Q96ST2	819 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANO3	Q9BYT9	981 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	STIM2	Q9P246	746 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	GJD2	Q9UKL4	321 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYH6	P13533	1939 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	VGLL3	A8MV65	326 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	MEIS2	O14770	477 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	XYLB	O75191	536 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMP1	P03956	469 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	VDR	P11473	427 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCND2	P30279	289 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRK4	P32298	578 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	GHRHR	Q02643	423 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	STXBP2	Q15833	593 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTPRO	Q16827	1216 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM26D	Q5JW98	314 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARMCX2	Q7L311	632 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	NLRX1	Q86UT6	975 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDILT	Q8N807	584 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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