RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ZNF20P17024 532 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 SLC9A1P19634 815 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 SURF1Q15526 300 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 PHF19Q5T6S3 580 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 C11orf74Q86VG3 221 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 JADE2Q9NQC1 790 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 KIF21BO75037 1637 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 RASSF10A6NK89 507 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 CYP17A1P05093 508 aa6.8□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 HERVK_113P62684 666 aa6.8□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.8□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ALG1L2C9J202 215 aa6.79□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 B4GALT4O60513 344 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS15P98073 1019 aa6.79□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 GPR158Q5T848 1215 aa6.78□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 TOMM22Q9NS69 142 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 BTBD7Q9P203 1132 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 AOAHP28039 575 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 GUCY2FP51841 1108 aa6.77□□□□□ -1.33
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TRDN-204ENST00000542443 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.77□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 CUX2O14529 1486 aa6.77□□□□□ -1.33
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TRDN-204ENST00000542443 ZXDAP98168 799 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 ICAM4Q14773 271 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 DTX3Q8N9I9 347 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.76□□□□□ -1.33
TRDN-204ENST00000542443 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.76□□□□□ -1.33
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