RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542313.2

ULK1-206, Transcript of unc-51 like autophagy activating kinase 1, human

TSL 3

Gene ULK1, Length 307 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ULK1-206	ENST00000542313	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	GBF1	Q92538	1859 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	CLCN3	P51790	818 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PRKCE	Q02156	737 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	INF2	Q27J81	1249 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	STBD1	O95210	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	MMP1	P03956	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	VCAN	P13611	3396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	DSC3	Q14574	896 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	UGCG	Q16739	394 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	WASF1	Q92558	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ITGB1	P05556	798 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	DNM2	P50570	870 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	GPC3	P51654	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PSMC5	P62195	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	HYAL1	Q12794	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	CAMK1	Q14012	370 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ULK1-206	ENST00000542313	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	TBX3	O15119	743 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	IL9	P15248	144 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	GATM	P50440	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	AK2	P54819	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	EML1	O00423	815 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	HOXA2	O43364	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	SLC37A4	O43826	429 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	MARCH6	O60337	910 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	COL9A1	P20849	921 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	DNAJB1	P25685	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	LTBR	P36941	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	UBE3A	Q05086	875 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	ADAM15	Q13444	863 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ULK1-206	ENST00000542313	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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