RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 VAV3Q9UKW4 847 aa18.82■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 MTERF2Q49AM1 385 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 EPC2Q52LR7 807 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 FIBCD1Q8N539 461 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0C4DFX4 3053 aa18.81■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.78■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 H3BNC9 293 aa18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS18Q9NS28 235 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP4-211ENST00000493436 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP4-211ENST00000493436 DNM2P50570 870 aa18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP4-211ENST00000493436 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 DRP2Q13474 957 aa18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP4-211ENST00000493436 LXNQ9BS40 222 aa18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP4-211ENST00000493436 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 ARID2Q68CP9 1835 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 C9IYK1 514 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 NEMFO60524 1076 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00271P0C7V0 271 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP2B1P20020 1258 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 NPEPPSP55786 919 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPROQ16827 1216 aa18.75■□□□□ 0.59
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