RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489712.6

NF1-213, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-213	ENST00000489712	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-213	ENST00000489712	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-213	ENST00000489712	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-213	ENST00000489712	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-213	ENST00000489712	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-213	ENST00000489712	ASMTL	O95671	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PRL	P01236	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	C6	P13671	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	TACR2	P21452	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ZNF174	Q15697	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CFHR4	Q92496	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	VPS11	Q9H270	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	MATN2	O00339	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	RFPL3	O75679	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	JMJD7	P0C870	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	DUSP8	Q13202	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	NME9	Q86XW9	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	EDA	Q92838	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CBX4	O00257	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	DVL2	O14641	736 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SLC26A4	O43511	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CYP17A1	P05093	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	HGFAC	Q04756	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	TCEA2	Q15560	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	LPP	Q93052	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	TRAF5	O00463	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SDS	P20132	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	RGS3	P49796	1198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	EPHA7	Q15375	998 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	DGKD	Q16760	1214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PIF1	Q9H611	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	GDF5	P43026	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ADAM15	Q13444	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	USP51	Q70EK9	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	APPBP2	Q92624	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	GAS7	O60861	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	FZD7	O75084	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	FSHB	P01225	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	AMH	P03971	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	HHEX	Q03014	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	RIN1	Q13671	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	GRM7	Q14831	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NF1-213	ENST00000489712	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms