RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 RBP3P10745 1247 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PAX3P23760 479 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 DNM2P50570 870 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 NEK3P51956 506 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 GALEQ14376 348 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 GRM3Q14832 879 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CREG2Q8IUH2 290 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC5A5Q92911 643 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SARGQ9BW04 601 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 DUSP13Q9UII6 198 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP12Q02952 1782 aa7.1□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 E9PCH4 1651 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SBNO1A3KN83 1393 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 WNT9AO14904 365 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PPFIA4O75335 1185 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 LTFP02788 710 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 POLD1P28340 1107 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 SESN3P58005 492 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 OCRLQ01968 901 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 FAPQ12884 760 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 INF2Q27J81 1249 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 BROXQ5VW32 411 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 MBLAC2Q68D91 279 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CBLL1Q75N03 491 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf74Q86VG3 221 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PJA1Q8NG27 643 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 DIO2Q92813 273 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ALG1Q9BT22 464 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 CBLCQ9ULV8 474 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP7BP35670 1465 aa7.09□□□□□ -1.27
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC37A3O60309 1634 aa7.09□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP2C19P33261 490 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 SEPHS1P49903 392 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNAB2Q13303 367 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC32Q14392 662 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 GBX1Q14549 363 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 DDB1Q16531 1140 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF827Q17R98 1081 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 TCTN2Q96GX1 697 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 LRGUKQ96M69 825 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 NAIPQ13075 1403 aa7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 APAF1O14727 1248 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 ASGR2P07307 311 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 VAV1P15498 845 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 EGR3Q06889 387 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 KIZQ2M2Z5 673 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 LONRF3Q496Y0 759 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 RTP2Q5QGT7 225 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXW5Q969U6 566 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 USP25Q9UHP3 1055 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.07□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 BMP8BP34820 402 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 SCAND1P57086 179 aa7.06□□□□□ -1.28
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT85P78386 507 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms