RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MKNK1Q9BUB5 465 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM198AQ9UFP1 575 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 AMACRQ9UHK6 382 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 SHC3Q92529 594 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL18Q96ME1 805 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MRIQ9BWK5 157 aa3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC188H7C350 402 aa3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 GFPT2O94808 682 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX29Q8TEQ0 813 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2SQ16763 222 aa3.96□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP9Q49MG5 647 aa3.96□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 Q4G0T1 1027 aa3.96□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 RELL1Q8IUW5 271 aa3.96□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.96□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.96□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC96Q2M329 555 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPRV1Q53RT3 343 aa3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP3Q96P20 1036 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 FSCN2O14926 492 aa3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 KRT12Q99456 494 aa3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 RLFQ13129 1914 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS72Q15906 364 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 EPS8L1Q8TE68 723 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 MAML1Q92585 1016 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ANO3Q9BYT9 981 aa3.96□□□□□ -1.78
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