RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221448.9

SNRNP70-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNRNP70, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70-201ENST00000221448 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 MAGEB2O15479 319 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 DRP2Q13474 957 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 PADI6Q6TGC4 694 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 RAD54LQ92698 747 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 A0A1W2PQ27 194 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 A0A1W2PQ64 194 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 A0A1W2PQD8 194 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 THPOP40225 353 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 EMC2Q15006 297 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 RETREG2Q8NC44 543 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP70-201ENST00000221448 RFC5P40937 340 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 NDUFA8P51970 172 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TMEM143Q96AN5 459 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 HIPK3Q9H422 1215 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TBX21Q9UL17 535 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 DGAT1O75907 488 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SYN1P17600 705 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RGS19P49795 217 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SLC12A3P55017 1021 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 GBP4Q96PP9 640 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 MTRQ99707 1265 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 AKT3Q9Y243 479 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 HPSEQ9Y251 543 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 PPME1Q9Y570 386 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 VTNP04004 478 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CTSHP09668 335 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TMOD1P28289 359 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 E2F4Q16254 413 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 STAMQ92783 540 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 STK17AQ9UEE5 414 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CKBP12277 381 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ITGB8P26012 769 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CYP2C18P33260 490 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 IQUBQ8NA54 791 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SYKP43405 635 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 GPBP1Q86WP2 473 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CYP11B2P19099 503 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 DNM2P50570 870 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CCL23P55773 120 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 BFSP2Q13515 415 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 ARSHQ5FYA8 562 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SV2BQ7L1I2 683 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RSPH3Q86UC2 560 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 KSR1Q8IVT5 923 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CAGE1Q8TC20 777 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 MAP7D2Q96T17 732 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 GINS2Q9Y248 185 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.03■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 KIAA0355O15063 1070 aa25.03■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RAG1P15918 1043 aa25.03■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.03■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.03■■□□□ 1.6
SNRNP70-201ENST00000221448 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms