RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MSL1Q68DK7 614 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD5Q6N075 450 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.4□□□□□ -1.06
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CAPNS1-202ENST00000586851 TEX11Q8IYF3 940 aa8.4□□□□□ -1.06
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CAPNS1-202ENST00000586851 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.4□□□□□ -1.06
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CAPNS1-202ENST00000586851 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 F8VZ95 297 aa8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB5O15062 677 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 NCK2O43639 380 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MGRN1O60291 552 aa8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 RPA1P27694 616 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 Q4G0T1 1027 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD16Q68DU8 428 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.39□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO1FO00160 1098 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 MAPK13O15264 365 aa8.38□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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CAPNS1-202ENST00000586851 MTA2O94776 668 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM153BP0C7A2 387 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 BCRP11274 1271 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 IL1R1P14778 569 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP11B2P19099 503 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-202ENST00000586851 PON1P27169 355 aa8.38□□□□□ -1.07
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