RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549	CHMP2A	O43633	222 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF862	O60290	1169 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	TDP2	O95551	362 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CYP3A7	P24462	503 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GPM6B	Q13491	265 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	UGCG	Q16739	394 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549		Q4G0T1	1027 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	METTL13	Q8N6R0	699 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SLC5A5	Q92911	643 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SAMD11	Q96NU1	681 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	RIT2	Q99578	217 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	COL1A2	P08123	1366 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	MGEA5	O60502	916 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PFKFB2	O60825	505 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GAS7	O60861	476 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	RPS6KA5	O75582	802 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	DGKI	O75912	1065 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CTDNEP1	O95476	244 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	VTN	P04004	478 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CTNNB1	P35222	781 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GATM	P50440	423 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PTPRO	Q16827	1216 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		11	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	TTC3	P53804	2025 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GRM6	O15303	877 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GPR32	O75388	356 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PSMD10	O75832	226 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CDKL5	O76039	1030 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	OAT	P04181	439 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	BMPR1A	P36894	532 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CLCN3	P51790	818 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	AK2	P54819	239 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ANAPC15	P60006	121 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PRKCE	Q02156	737 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	INF2	Q27J81	1249 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	GALNT17	Q6IS24	598 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	NECAB1	Q8N987	351 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	FAM167A	Q96KS9	214 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	OSMR	Q99650	979 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SI	P14410	1827 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	MAGEB2	O15479	319 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SLC37A4	O43826	429 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	LARGE1	O95461	756 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	SEC24B	O95487	1268 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	JAK3	P52333	1124 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
GCN1-208	ENST00000551549	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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