RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.01■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.01■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 JAK2O60674 1132 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 XBP1P17861 261 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 LETM2Q2VYF4 491 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 NME8Q8N427 588 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 GDPD5Q8WTR4 605 aa26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 COL4A6Q14031 1691 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 FAM205CA6NFA0 338 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 M0QZ92 97 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 ENPP3O14638 875 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 JAK3P52333 1124 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 WASF1Q92558 559 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 YME1L1Q96TA2 773 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 SQORQ9Y6N5 450 aa25.99■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 OATP04181 439 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 SFNP31947 248 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 PRKCEQ02156 737 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 NR5A1Q13285 461 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 NEK8Q86SG6 692 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 KIF2CQ99661 725 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 PADI3Q9ULW8 664 aa25.98■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 TNFRSF25Q93038 417 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 FAM167AQ96KS9 214 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 GINS2Q9Y248 185 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 TRANK1O15050 2925 aa25.97■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 PAK2Q13177 524 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 METTL13Q8N6R0 699 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 RDM1Q8NG50 284 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 TMX1Q9H3N1 280 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 EVPLQ92817 2033 aa25.96■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
PSME4-208ENST00000481518 VTNP04004 478 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 KRT2P35908 639 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 CLCN3P51790 818 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 FOSBP53539 338 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 VAV3Q9UKW4 847 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 A0A0C4DFX4 3053 aa25.95■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 TMEM150BA6NC51 233 aa25.94■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 STBD1O95210 358 aa25.94■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 KIZQ2M2Z5 673 aa25.94■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.94■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 EML1O00423 815 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 GPR32O75388 356 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 HAS1Q92839 578 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 OSMRQ99650 979 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 THEGQ9P2T0 379 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 TTC3P53804 2025 aa25.93■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 MAGEB2O15479 319 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 MMP1P03956 469 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 LINC00271P0C7V0 271 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 PPP2R5CQ13362 524 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 EPC2Q52LR7 807 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 POTEDQ86YR6 584 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 BANK1Q8NDB2 785 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 FBXO22Q8NEZ5 403 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 FAM20AQ96MK3 541 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 REV3LO60673 3130 aa25.92■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 BTBD18B2RXH4 712 aa25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 MGEA5O60502 916 aa25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 CEP89Q96ST8 783 aa25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.91■■□□□ 1.74
PSME4-208ENST00000481518 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms