RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 LCMT1Q9UIC8 334 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SIPA1L1O43166 1804 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FTCDO95954 541 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 PRR16Q569H4 304 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 HINFPQ9BQA5 517 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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OPN3-204ENST00000469376 A6NNZ2 444 aa28.33■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 EGFRP00533 1210 aa28.33■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.33■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 TUBB8Q3ZCM7 444 aa28.33■■■□□ 2.13
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OPN3-204ENST00000469376 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa28.33■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SFR1Q86XK3 245 aa28.33■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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OPN3-204ENST00000469376 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.33■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 RAD21O60216 631 aa28.32■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 CASP5P51878 434 aa28.32■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.31■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.31■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.31■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 PTK2Q05397 1052 aa28.3■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 USP38Q8NB14 1042 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 PBKQ96KB5 322 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 PON1P27169 355 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 HOXD13P35453 343 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 ICA1Q05084 483 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 RPS6KA1Q15418 735 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.3■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 ACTN1P12814 892 aa28.29■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 SLC9A1P19634 815 aa28.29■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 IRAK1P51617 712 aa28.29■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 SKOR1P84550 965 aa28.29■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 MEIS1O00470 390 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 TBCAO75347 108 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 FLOT1O75955 427 aa28.28■■■□□ 2.12
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OPN3-204ENST00000469376 NR3C1P04150 777 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 CYP3A4P08684 503 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 MYBP10242 640 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 KLRC3Q07444 240 aa28.28■■■□□ 2.12
OPN3-204ENST00000469376 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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