RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CD209Q9NNX6 404 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ABCC6O95255 1503 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MCF2LO15068 1137 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 OSBPP22059 807 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 STILQ15468 1287 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SCN4AP35499 1836 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF839A8K0R7 811 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MTSS1O43312 755 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RHOXF2BP0C7M4 288 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SCG2P13521 617 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EEF2P13639 858 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TFCP2Q12800 502 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ALX1Q15699 326 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GNPTABQ3T906 1256 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF677Q86XU0 584 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DHX58Q96C10 678 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL29Q96CT2 875 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CYTH2Q99418 400 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CTSWP56202 376 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NUP107P57740 925 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TNNI3KQ59H18 835 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf89Q6UX73 402 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFAF2Q8N183 169 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC126Q96EE4 140 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF35A5YM69 484 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 M0QZ92 97 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KCNQ3O43525 872 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 RPL26P61254 145 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ACAD11Q709F0 780 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 AIPL1Q9NZN9 384 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 H0Y3Z8 333 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 OR52Z1P0C646 297 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 CASP8Q14790 479 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FERMT3Q86UX7 667 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LCA5Q86VQ0 697 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 USP28Q96RU2 1077 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MEIS3Q99687 375 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 H0Y626 953 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 KRT6AP02538 564 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf167Q5SNV9 1468 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NPEPPSP55786 919 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 STX3Q13277 289 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MTX1Q13505 466 aa5.26□□□□□ -1.57
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