RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 UBE4BO95155 1302 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ANO9A1A5B4 782 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 OATP04181 439 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ALS2CLQ60I27 953 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TTC39CQ8N584 583 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TTC16Q8NEE8 873 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CERKQ8TCT0 537 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 DPH5Q9H2P9 285 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 K7ERI5 159 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SGO2Q562F6 1265 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KCND2Q9NZV8 630 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KIF28PB7ZC32 967 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 F5H6K3 240 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MCF2LO15068 1137 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MYBL1P10243 752 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA1LP34931 641 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PRCPP42785 496 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GNGT1P63211 74 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KLRC3Q07444 240 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PADI6Q6TGC4 694 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 VSIG1Q86XK7 387 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RUBCNQ92622 972 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 LPAR1Q92633 364 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF302Q9NR11 478 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC188H7C350 402 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KRT1P04264 644 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CDC25AP30304 524 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PSMC5P62195 406 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SESTD1Q86VW0 696 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SFR1Q86XK3 245 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KCNB2Q92953 911 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 DYDC2Q96IM9 177 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ACAD9Q9H845 621 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PHKA2P46019 1235 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SNAP25P60880 206 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SHC4Q6S5L8 630 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ARMCX2Q7L311 632 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GDAQ9Y2T3 454 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 POTEMA6NI47 508 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 H7C0C1 242 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5OP48047 213 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF131P52739 623 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PEX3P56589 373 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 EPHA7Q15375 998 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 BBS5Q8N3I7 341 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 WRNIP1Q96S55 665 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM260Q9NX78 707 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC151A5D8V7 595 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L15C9J2P7 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L11C9JVI0 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L18D6R9N7 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L22D6RA61 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L19D6RCP7 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L20D6RJB6 530 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SGK1O00141 431 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 IFNB1P01574 187 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PRR29P0C7W0 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA13P27216 316 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L24Q0WX57 530 aa6.98□□□□□ -1.29
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