RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 FBXW5Q969U6 566 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 CBLCQ9ULV8 474 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.34□□□□□ -1.71
CCDC82-202ENST00000423339 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 WNT9AO14904 365 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 MAFKO60675 156 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 C8BP07358 591 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DNM2P50570 870 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ST5P78524 1137 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 GRIN1Q05586 938 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 OSTM1Q86WC4 334 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 MIB1Q86YT6 1006 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DDX11Q96FC9 970 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF341Q9BYN7 854 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DSEQ9UL01 958 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.33□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC66A2RUB6 948 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 LAMTOR5O43504 91 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CKMP06732 381 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PDE6AP16499 860 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 KCNA6P17658 529 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CNGA1P29973 690 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 SELENOPP49908 381 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TUSC3Q13454 348 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF460Q14592 562 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 STK32CQ86UX6 486 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 KIF18BQ86Y91 864 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 NOX5Q96PH1 765 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CD244Q9BZW8 370 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 MTFR1LQ9H019 292 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 KCNK3O14649 394 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PPFIA2O75334 1257 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 AMY2AP04746 511 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 JMJD7P0C870 316 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 KRT15P19012 456 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 AMY2BP19961 511 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 JAM2P57087 298 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DHCR24Q15392 516 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CR1LQ2VPA4 569 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DTLQ9NZJ0 730 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.32□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 MUSKO15146 869 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 GSTA4O15217 222 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 LRG1P02750 347 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CYP2C8P10632 490 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 NEK4P51957 841 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ICAM4Q14773 271 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CRY1Q16526 586 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CFAP100Q494V2 611 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TEPPQ6URK8 271 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 MCM8Q9UJA3 840 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CBX4O00257 560 aa4.3□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 CPEP16870 476 aa4.3□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 NKX3-2P78367 333 aa4.3□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 ABHD18Q0P651 414 aa4.3□□□□□ -1.72
CCDC82-202ENST00000423339 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.7 ms