RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 STK32BQ9NY57 414 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 A6NJR5 290 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SGK1O00141 431 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FGGP02679 453 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MYL1P05976 194 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 HSPA6P17066 643 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 GIPC2Q8TF65 315 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 ITKQ08881 620 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ERFEQ4G0M1 354 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 HIPK4Q8NE63 616 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 IL25Q9H293 177 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DEPDC5O75140 1603 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 XDHP47989 1333 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 H7C0C1 242 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5OP48047 213 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 RCAN1P53805 252 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SLMAPQ14BN4 828 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DCLK2Q8N568 766 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 THAP9Q9H5L6 903 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 GMNCA6NCL1 334 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 KIF22Q14807 665 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FGD4Q96M96 766 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 MYL7Q01449 175 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CUL1Q13616 776 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PDXDC1Q6P996 788 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 COG1Q8WTW3 980 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 MT-ND3P03897 115 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP14Q86W24 1093 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TBCKQ8TEA7 893 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINI1Q99574 410 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 PYGBP11216 843 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 GUCY1A3Q02108 690 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 XKR9Q5GH70 373 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.53□□□□□ -0.88
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