RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRMP28827 1452 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 C3P01024 1663 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TRAF5O00463 557 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 OPHN1O60890 802 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 FCGR1AP12314 374 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 INHBAP08476 426 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 TSPYL6Q8N831 410 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 TMCC1O94876 653 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 WDR93Q6P2C0 686 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CCNJLQ8IV13 435 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 PTPREP23469 700 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 RPS6KA2Q15349 733 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
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