RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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PTPRE-201ENST00000254667 SAT1P21673 171 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRE-201ENST00000254667 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRE-201ENST00000254667 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRE-201ENST00000254667 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.43■□□□□ 0.86
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