RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 GUCY2FP51841 1108 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SLC12A2P55011 1212 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MTERF2Q49AM1 385 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ENTPD3O75355 529 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 STX2P32856 288 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 COASYQ13057 564 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NAALADL2Q58DX5 795 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PDXDC2PQ6P474 469 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NLRP7Q8WX94 980 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RASSF4Q9H2L5 321 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP4P98171 946 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GABPAQ06546 454 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KYAT1Q16773 422 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf86Q6ZW13 317 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RFX6Q8HWS3 928 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 OXER1Q8TDS5 423 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KNDC1Q76NI1 1749 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 C3P01024 1663 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GFPT2O94808 682 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PSMC4P43686 418 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SCARF1Q14162 830 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MESDQ14696 234 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SLFNL1Q499Z3 407 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KCNV1Q6PIU1 500 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PPP4R1Q8TF05 950 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CDKL2Q92772 493 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CABS1Q96KC9 395 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MSTO1Q9BUK6 570 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CNGA1P29973 690 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NEDD9Q14511 834 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 STOX1Q6ZVD7 989 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NBPF3Q9H094 633 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 BHMT2Q9H2M3 363 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 FLT1P17948 1338 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 IFT172Q9UG01 1749 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KCNQ2O43526 872 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NMT2O60551 498 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ECEL1O95672 775 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MMP14P50281 582 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GEN1Q17RS7 908 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 WHAMMQ8TF30 809 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SLC10A4Q96EP9 437 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CAPS2Q9BXY5 557 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GINM1Q9NU53 330 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PQC6 194 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 TBX3O15119 743 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 COBLO75128 1261 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MOCS3O95396 460 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GNAT1P11488 350 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 AP3M2P53677 418 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MTRQ99707 1265 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MEGF6O75095 1541 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NR3C1P04150 777 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GUCY2DQ02846 1103 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 CUL1Q13616 776 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SLMAPQ14BN4 828 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MORC4Q8TE76 937 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RMDN3Q96TC7 470 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 NYAP2Q9P242 653 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.99□□□□□ -1.29
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