RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PCYT2	Q99447	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ENPP3	O14638	875 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX10	O75333	385 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	BMPR1A	P36894	532 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	IGBP1	P78318	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR1	Q13613	665 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMK1	Q14012	370 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CLUL1	Q15846	466 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01565	O15544	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	DCX	O43602	365 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	DGKI	O75912	1065 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RB1	P06400	928 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CD52	P31358	61 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GLG1	Q92896	1179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP1	P03956	469 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ALAD	P13716	330 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	INSRR	P14616	1297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB1	P25685	340 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MCM5	P33992	734 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IRS1	P35568	1242 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TECTA	O75443	2155 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC27A2	O14975	620 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MBTPS2	O43462	519 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LIFR	P42702	1097 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GNAQ	P50148	359 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GATM	P50440	423 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	EVPL	Q92817	2033 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB1	P05556	798 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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