RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 GMCL1Q96IK5 515 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 SELENOOQ9BVL4 669 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 POLD4Q9HCU8 107 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 DNM3Q9UQ16 869 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 ARID5AQ03989 594 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 RAPGEF1Q13905 1077 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 AIPL1Q9NZN9 384 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 SCN9AQ15858 1988 aa17.14■□□□□ 0.34
ANKRD54-210ENST00000498417 A0A087X0T9 212 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 A0A1W2PRG0 241 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM228BP0C875 321 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ACTN1P12814 892 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CIITAP33076 1130 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 HSPA1LP34931 641 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM133AQ8N9E0 248 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ERMNQ8TAM6 284 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 VAV3Q9UKW4 847 aa17.14■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 GH2P01242 217 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RSPH10BP0C881 870 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 MYBP10242 640 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 KLRC1P26715 233 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 NAB2Q15742 525 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC18A3Q16572 532 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM20AQ96MK3 541 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 EML1O00423 815 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 BMP3P12645 472 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC9A1P19634 815 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC7A5Q01650 507 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CYP4A11Q02928 519 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ZSCAN26Q16670 478 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 MSL1Q68DK7 614 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 MS4A14Q96JA4 679 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PACSIN1Q9BY11 444 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 AGPSO00116 658 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RNF40O75150 1001 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 KLHL30Q0D2K2 578 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 MCTP2Q6DN12 878 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RUSC1Q9BVN2 902 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PALMO75781 387 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 POLD1P28340 1107 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 MUM1L1Q5H9M0 696 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC181Q5TID7 509 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FRMD5Q7Z6J6 570 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM204AQ9H8W3 233 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RGL1Q9NZL6 768 aa17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 GGCXP38435 758 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 EPS15P42566 896 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC70Q6NSX1 233 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PDXKO00764 312 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 AKAP3O75969 853 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 FTCDO95954 541 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ACTN2P35609 894 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 KCNA1Q09470 495 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 ASIC2Q16515 512 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CYP3A4P08684 503 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CAPN2P17655 700 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PAFAH1B1P43034 410 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA0753Q2KHM9 967 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 AFPP02771 609 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 UCHL3P15374 230 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 PON1P27169 355 aa17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54-210ENST00000498417 CASP4P49662 377 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms