RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	NTF4	P34130	210 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTO1	P78417	241 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNIP1	Q15025	636 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SBK1	Q52WX2	424 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf60	Q5U649	245 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX11	Q8IYF3	940 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPF2	Q92785	391 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEKT1	Q969V4	418 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	IDI2	Q9BXS1	227 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC18	Q9H819	358 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMYM6	O95789	1325 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATE1	O95260	518 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	LARGE1	O95461	756 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	BPNT1	O95861	308 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	APP	P05067	770 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANAPC15	P60006	121 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARID5A	Q03989	594 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABPA	Q06546	454 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPARA	Q07869	468 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUFY3	Q7L099	469 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	HDX	Q7Z353	690 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPC2	Q8N158	579 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEPSIN	Q96N21	525 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSME4	Q14997	1843 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDM1	O75626	825 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAG3	O95817	575 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNAT2	P19087	354 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCP10	Q12799	353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PICALM	Q13492	652 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLGAP5	Q15398	846 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAPB	Q9H115	298 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SBF1	O95248	1867 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266		B4E1Z4	1266 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	FANCG	O15287	622 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NMT2	O60551	498 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DRD2	P14416	443 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS6KB1	P23443	525 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUCY1A2	P33402	732 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHMT1	P34896	483 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRNA4	P43681	627 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	PREP	P48147	710 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	TDO2	P48775	406 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF165	P49910	485 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEK4	P51957	841 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	AK2	P54819	239 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABEP1	Q15276	862 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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