RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 B3GNT9Q6UX72 402 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 SERINC5Q86VE9 423 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 CAGE1Q8TC20 777 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 AFAP1L1Q8TED9 768 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 LMBR1Q8WVP7 490 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.78■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 NRCAMQ92823 1304 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 BACH1O14867 736 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 IQCF3P0C7M6 154 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 ACRP10323 421 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 ATP4AP20648 1035 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 GJB2P29033 226 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 CUL4AQ13619 759 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 HAS1Q92839 578 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.441e-27■■□□□ 12.9
ACTB-206ENST00000443528 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 IL23AQ9NPF7 189 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 ZNF302Q9NR11 478 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.77■□□□□ 0.44
ACTB-206ENST00000443528 KIF28PB7ZC32 967 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 PSAPP07602 524 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 GNAT1P11488 350 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 CKBP12277 381 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 INSRRP14616 1297 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 PPFIA1Q13136 1202 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 GRIK4Q16099 956 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TMEM240Q5SV17 173 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 MARCH8Q5T0T0 291 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 FAM160B1Q5W0V3 765 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TRAF7Q6Q0C0 670 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 POTEDQ86YR6 584 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RETREG2Q8NC44 543 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 DISC1Q9NRI5 854 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 POTEB3A0JP26 581 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 WDR64B1ANS9 1081 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TBX3O15119 743 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 CHMP2AO43633 222 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 SLC26A2P50443 739 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.432e-13■□□□□ 11.2
ACTB-206ENST00000443528 GPNMBQ14956 572 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ZNF618Q5T7W0 954 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 PDXDC2PQ6P474 469 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 POTEBQ6S5H4 581 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ZNF365Q70YC5 407 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 FAM20AQ96MK3 541 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TRPC6Q9Y210 931 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 SAMM50Q9Y512 469 aa17.75■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 SELPP16109 830 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.433e-17■□□□□ 9.4
ACTB-206ENST00000443528 SFNP31947 248 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 JAK3P52333 1124 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 IGBP1P78318 339 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RUFY4Q6ZNE9 571 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 LRRC8DQ7L1W4 858 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ATP8B4Q8TF62 1192 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 VAV3Q9UKW4 847 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 KIF3AQ9Y496 699 aa17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ZNF862O60290 1169 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 HBP1O60381 514 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RFC2P35250 354 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 THPOP40225 353 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 UGCGQ16739 394 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RASIP1Q5U651 963 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 DEFB128Q7Z7B8 93 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 RDM1Q8NG50 284 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 LAMA3Q16787 3333 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TANC1Q9C0D5 1861 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 EML1O00423 815 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 FGBP02675 491 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 ATP2B1P20020 1258 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 PPP2R5CQ13362 524 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 MBTPS1Q14703 1052 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-206ENST00000443528 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
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